Chuyển đổi số y tế tại các bệnh viện lớn gặp khó khăn do tư duy và quy trình chuyên môn, quản lý phức tạp. Hạ tầng và công nghệ chưa đồng bộ dẫn đến kết nối dữ liệu khó khăn. Triển khai bệnh án điện tử cần đầu tư lớn về CNTT, nhưng chi phí này chưa được tính vào giá dịch vụ khám chữa bệnh.
Bệnh án điện tử đang đối mặt với khó khăn về tài chính, nhân lực và hạ tầng kỹ thuật. Cử tri tại Hải Phòng đề nghị hỗ trợ nguồn lực và kỹ thuật để các bệnh viện tuyến huyện triển khai hiệu quả. Bộ Y tế đã ban hành văn bản về chuyển đổi số y tế, tạo hạ tảng pháp lý cho bệnh án điện tử để xây dựng hệ thống chăm sóc sức khỏe và phòng bệnh dựa trên công nghệ số.