Sở An toàn thực phẩm TP.HCM là cơ quan chuyên môn giúp UBND TP.HCM quản lý nhà nước về an toàn thực phẩm. Sở có nhiệm vụ kiểm tra, xử lý vi phạm và thực hiện thẩm định, cấp giấy phép, chứng nhận an toàn thực phẩm. Sở cũng quản lý chất lượng dịch vụ, sản phẩm, hàng hóa và cấp giấy chứng nhận lưu hành tự do cho sản phẩm thực phẩm xuất khẩu.
